Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3R8

NEK5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK5Q6P3R8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK5Q6P3R8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEK5Q6P3R8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms