Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2D8

XRRA1, X-ray radiation resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRRA1Q6P2D8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
XRRA1Q6P2D8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
XRRA1Q6P2D8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
XRRA1Q6P2D8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
XRRA1Q6P2D8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
XRRA1Q6P2D8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
XRRA1Q6P2D8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
XRRA1Q6P2D8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
XRRA1Q6P2D8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XRRA1Q6P2D8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XRRA1Q6P2D8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XRRA1Q6P2D8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XRRA1Q6P2D8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
XRRA1Q6P2D8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XRRA1Q6P2D8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XRRA1Q6P2D8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
XRRA1Q6P2D8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
XRRA1Q6P2D8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XRRA1Q6P2D8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
XRRA1Q6P2D8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
XRRA1Q6P2D8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
XRRA1Q6P2D8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
XRRA1Q6P2D8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
XRRA1Q6P2D8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XRRA1Q6P2D8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XRRA1Q6P2D8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XRRA1Q6P2D8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
XRRA1Q6P2D8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
XRRA1Q6P2D8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
XRRA1Q6P2D8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XRRA1Q6P2D8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XRRA1Q6P2D8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XRRA1Q6P2D8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
XRRA1Q6P2D8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
XRRA1Q6P2D8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
XRRA1Q6P2D8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
XRRA1Q6P2D8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
XRRA1Q6P2D8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XRRA1Q6P2D8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
XRRA1Q6P2D8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XRRA1Q6P2D8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XRRA1Q6P2D8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
XRRA1Q6P2D8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
XRRA1Q6P2D8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XRRA1Q6P2D8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
XRRA1Q6P2D8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
XRRA1Q6P2D8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
XRRA1Q6P2D8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XRRA1Q6P2D8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
XRRA1Q6P2D8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
XRRA1Q6P2D8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XRRA1Q6P2D8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
XRRA1Q6P2D8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XRRA1Q6P2D8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XRRA1Q6P2D8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
XRRA1Q6P2D8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XRRA1Q6P2D8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XRRA1Q6P2D8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XRRA1Q6P2D8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
XRRA1Q6P2D8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
XRRA1Q6P2D8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
XRRA1Q6P2D8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
XRRA1Q6P2D8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
XRRA1Q6P2D8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XRRA1Q6P2D8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XRRA1Q6P2D8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XRRA1Q6P2D8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms