Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUM9

RETSAT, All-trans-retinol 13,14-reductase, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETSATQ6NUM9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RETSATQ6NUM9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RETSATQ6NUM9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RETSATQ6NUM9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RETSATQ6NUM9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RETSATQ6NUM9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RETSATQ6NUM9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RETSATQ6NUM9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RETSATQ6NUM9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RETSATQ6NUM9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RETSATQ6NUM9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RETSATQ6NUM9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RETSATQ6NUM9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RETSATQ6NUM9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RETSATQ6NUM9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RETSATQ6NUM9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RETSATQ6NUM9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RETSATQ6NUM9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RETSATQ6NUM9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RETSATQ6NUM9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RETSATQ6NUM9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RETSATQ6NUM9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RETSATQ6NUM9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RETSATQ6NUM9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RETSATQ6NUM9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RETSATQ6NUM9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RETSATQ6NUM9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RETSATQ6NUM9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RETSATQ6NUM9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RETSATQ6NUM9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RETSATQ6NUM9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms