Protein–RNA interactions for Protein: Q6IAA8

LAMTOR1, Ragulator complex protein LAMTOR1, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR1Q6IAA8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LAMTOR1Q6IAA8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMTOR1Q6IAA8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMTOR1Q6IAA8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMTOR1Q6IAA8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMTOR1Q6IAA8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LAMTOR1Q6IAA8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMTOR1Q6IAA8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMTOR1Q6IAA8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMTOR1Q6IAA8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMTOR1Q6IAA8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMTOR1Q6IAA8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMTOR1Q6IAA8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMTOR1Q6IAA8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMTOR1Q6IAA8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMTOR1Q6IAA8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMTOR1Q6IAA8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMTOR1Q6IAA8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMTOR1Q6IAA8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMTOR1Q6IAA8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMTOR1Q6IAA8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMTOR1Q6IAA8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMTOR1Q6IAA8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMTOR1Q6IAA8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMTOR1Q6IAA8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms