Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CARMIL2Q6F5E8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
CARMIL2Q6F5E8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
CARMIL2Q6F5E8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CARMIL2Q6F5E8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
CARMIL2Q6F5E8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
CARMIL2Q6F5E8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
CARMIL2Q6F5E8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CARMIL2Q6F5E8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CARMIL2Q6F5E8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CARMIL2Q6F5E8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC39.12■■■■□ 3.85
CARMIL2Q6F5E8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
CARMIL2Q6F5E8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
CARMIL2Q6F5E8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CARMIL2Q6F5E8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CARMIL2Q6F5E8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CARMIL2Q6F5E8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CARMIL2Q6F5E8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CARMIL2Q6F5E8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
CARMIL2Q6F5E8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CARMIL2Q6F5E8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CARMIL2Q6F5E8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
CARMIL2Q6F5E8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
CARMIL2Q6F5E8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.85
CARMIL2Q6F5E8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
CARMIL2Q6F5E8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
CARMIL2Q6F5E8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC39.07■■■■□ 3.84
CARMIL2Q6F5E8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
CARMIL2Q6F5E8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CARMIL2Q6F5E8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CARMIL2Q6F5E8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
CARMIL2Q6F5E8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
CARMIL2Q6F5E8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CARMIL2Q6F5E8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
CARMIL2Q6F5E8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
CARMIL2Q6F5E8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
CARMIL2Q6F5E8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
CARMIL2Q6F5E8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
CARMIL2Q6F5E8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
CARMIL2Q6F5E8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
CARMIL2Q6F5E8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
CARMIL2Q6F5E8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CARMIL2Q6F5E8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CARMIL2Q6F5E8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CARMIL2Q6F5E8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CARMIL2Q6F5E8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CARMIL2Q6F5E8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CARMIL2Q6F5E8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CARMIL2Q6F5E8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CARMIL2Q6F5E8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CARMIL2Q6F5E8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CARMIL2Q6F5E8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CARMIL2Q6F5E8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CARMIL2Q6F5E8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CARMIL2Q6F5E8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CARMIL2Q6F5E8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC39■■■■□ 3.83
CARMIL2Q6F5E8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC39■■■■□ 3.83
CARMIL2Q6F5E8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CARMIL2Q6F5E8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CARMIL2Q6F5E8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CARMIL2Q6F5E8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CARMIL2Q6F5E8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CARMIL2Q6F5E8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
CARMIL2Q6F5E8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
CARMIL2Q6F5E8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CARMIL2Q6F5E8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CARMIL2Q6F5E8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CARMIL2Q6F5E8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CARMIL2Q6F5E8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CARMIL2Q6F5E8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
CARMIL2Q6F5E8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CARMIL2Q6F5E8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
CARMIL2Q6F5E8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
CARMIL2Q6F5E8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CARMIL2Q6F5E8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CARMIL2Q6F5E8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CARMIL2Q6F5E8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CARMIL2Q6F5E8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CARMIL2Q6F5E8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CARMIL2Q6F5E8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
CARMIL2Q6F5E8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC38.92■■■■□ 3.82
CARMIL2Q6F5E8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
CARMIL2Q6F5E8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
CARMIL2Q6F5E8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
CARMIL2Q6F5E8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CARMIL2Q6F5E8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
CARMIL2Q6F5E8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
CARMIL2Q6F5E8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CARMIL2Q6F5E8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CARMIL2Q6F5E8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CARMIL2Q6F5E8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
CARMIL2Q6F5E8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
CARMIL2Q6F5E8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
CARMIL2Q6F5E8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC38.88■■■■□ 3.81
CARMIL2Q6F5E8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CARMIL2Q6F5E8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms