Protein–RNA interactions for Protein: Q68D06

SLFN13, Schlafen family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN13Q68D06 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLFN13Q68D06 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLFN13Q68D06 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLFN13Q68D06 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLFN13Q68D06 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLFN13Q68D06 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLFN13Q68D06 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLFN13Q68D06 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLFN13Q68D06 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLFN13Q68D06 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLFN13Q68D06 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLFN13Q68D06 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLFN13Q68D06 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLFN13Q68D06 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLFN13Q68D06 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLFN13Q68D06 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SLFN13Q68D06 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLFN13Q68D06 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLFN13Q68D06 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLFN13Q68D06 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLFN13Q68D06 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLFN13Q68D06 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLFN13Q68D06 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLFN13Q68D06 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLFN13Q68D06 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SLFN13Q68D06 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLFN13Q68D06 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLFN13Q68D06 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SLFN13Q68D06 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLFN13Q68D06 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLFN13Q68D06 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms