Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B1

RNF219, RING finger protein 219, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF219Q5W0B1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF219Q5W0B1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF219Q5W0B1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF219Q5W0B1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF219Q5W0B1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF219Q5W0B1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF219Q5W0B1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF219Q5W0B1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF219Q5W0B1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF219Q5W0B1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF219Q5W0B1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF219Q5W0B1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF219Q5W0B1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF219Q5W0B1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF219Q5W0B1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF219Q5W0B1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF219Q5W0B1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF219Q5W0B1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF219Q5W0B1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF219Q5W0B1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF219Q5W0B1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms