Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GARNL3Q5VVW2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms