Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FNDC7Q5VTL7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms