Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT97

SYDE2, Rho GTPase-activating protein SYDE2, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE2Q5VT97 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYDE2Q5VT97 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYDE2Q5VT97 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYDE2Q5VT97 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYDE2Q5VT97 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYDE2Q5VT97 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYDE2Q5VT97 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYDE2Q5VT97 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYDE2Q5VT97 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYDE2Q5VT97 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYDE2Q5VT97 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYDE2Q5VT97 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYDE2Q5VT97 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYDE2Q5VT97 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYDE2Q5VT97 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYDE2Q5VT97 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYDE2Q5VT97 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYDE2Q5VT97 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYDE2Q5VT97 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYDE2Q5VT97 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYDE2Q5VT97 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYDE2Q5VT97 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYDE2Q5VT97 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SYDE2Q5VT97 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYDE2Q5VT97 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYDE2Q5VT97 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYDE2Q5VT97 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYDE2Q5VT97 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYDE2Q5VT97 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYDE2Q5VT97 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYDE2Q5VT97 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYDE2Q5VT97 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYDE2Q5VT97 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYDE2Q5VT97 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYDE2Q5VT97 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYDE2Q5VT97 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SYDE2Q5VT97 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SYDE2Q5VT97 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYDE2Q5VT97 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYDE2Q5VT97 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYDE2Q5VT97 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYDE2Q5VT97 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYDE2Q5VT97 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYDE2Q5VT97 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SYDE2Q5VT97 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYDE2Q5VT97 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYDE2Q5VT97 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYDE2Q5VT97 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYDE2Q5VT97 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SYDE2Q5VT97 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYDE2Q5VT97 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYDE2Q5VT97 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SYDE2Q5VT97 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYDE2Q5VT97 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYDE2Q5VT97 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYDE2Q5VT97 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYDE2Q5VT97 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYDE2Q5VT97 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYDE2Q5VT97 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYDE2Q5VT97 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms