Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
LDLRAD1Q5T700 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
LDLRAD1Q5T700 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LDLRAD1Q5T700 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LDLRAD1Q5T700 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LDLRAD1Q5T700 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LDLRAD1Q5T700 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LDLRAD1Q5T700 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LDLRAD1Q5T700 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LDLRAD1Q5T700 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LDLRAD1Q5T700 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LDLRAD1Q5T700 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
LDLRAD1Q5T700 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LDLRAD1Q5T700 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LDLRAD1Q5T700 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
LDLRAD1Q5T700 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LDLRAD1Q5T700 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LDLRAD1Q5T700 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LDLRAD1Q5T700 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LDLRAD1Q5T700 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LDLRAD1Q5T700 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LDLRAD1Q5T700 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LDLRAD1Q5T700 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LDLRAD1Q5T700 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LDLRAD1Q5T700 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LDLRAD1Q5T700 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LDLRAD1Q5T700 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LDLRAD1Q5T700 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LDLRAD1Q5T700 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LDLRAD1Q5T700 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LDLRAD1Q5T700 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LDLRAD1Q5T700 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LDLRAD1Q5T700 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LDLRAD1Q5T700 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LDLRAD1Q5T700 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LDLRAD1Q5T700 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LDLRAD1Q5T700 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LDLRAD1Q5T700 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LDLRAD1Q5T700 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LDLRAD1Q5T700 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
LDLRAD1Q5T700 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LDLRAD1Q5T700 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
LDLRAD1Q5T700 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms