Protein–RNA interactions for Protein: Q5T447

HECTD3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD3Q5T447 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HECTD3Q5T447 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HECTD3Q5T447 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HECTD3Q5T447 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HECTD3Q5T447 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HECTD3Q5T447 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HECTD3Q5T447 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HECTD3Q5T447 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HECTD3Q5T447 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HECTD3Q5T447 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HECTD3Q5T447 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HECTD3Q5T447 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms