Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRAPPC3LQ5T215 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRAPPC3LQ5T215 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRAPPC3LQ5T215 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRAPPC3LQ5T215 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRAPPC3LQ5T215 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRAPPC3LQ5T215 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRAPPC3LQ5T215 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRAPPC3LQ5T215 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRAPPC3LQ5T215 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
TRAPPC3LQ5T215 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRAPPC3LQ5T215 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
TRAPPC3LQ5T215 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRAPPC3LQ5T215 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRAPPC3LQ5T215 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRAPPC3LQ5T215 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRAPPC3LQ5T215 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRAPPC3LQ5T215 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRAPPC3LQ5T215 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRAPPC3LQ5T215 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
TRAPPC3LQ5T215 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRAPPC3LQ5T215 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRAPPC3LQ5T215 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRAPPC3LQ5T215 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRAPPC3LQ5T215 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRAPPC3LQ5T215 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
TRAPPC3LQ5T215 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
TRAPPC3LQ5T215 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRAPPC3LQ5T215 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TRAPPC3LQ5T215 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TRAPPC3LQ5T215 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TRAPPC3LQ5T215 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TRAPPC3LQ5T215 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TRAPPC3LQ5T215 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRAPPC3LQ5T215 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRAPPC3LQ5T215 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRAPPC3LQ5T215 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRAPPC3LQ5T215 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRAPPC3LQ5T215 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
TRAPPC3LQ5T215 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRAPPC3LQ5T215 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRAPPC3LQ5T215 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRAPPC3LQ5T215 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRAPPC3LQ5T215 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRAPPC3LQ5T215 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRAPPC3LQ5T215 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRAPPC3LQ5T215 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRAPPC3LQ5T215 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRAPPC3LQ5T215 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRAPPC3LQ5T215 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TRAPPC3LQ5T215 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TRAPPC3LQ5T215 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TRAPPC3LQ5T215 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TRAPPC3LQ5T215 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TRAPPC3LQ5T215 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TRAPPC3LQ5T215 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRAPPC3LQ5T215 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
TRAPPC3LQ5T215 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
TRAPPC3LQ5T215 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRAPPC3LQ5T215 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRAPPC3LQ5T215 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRAPPC3LQ5T215 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRAPPC3LQ5T215 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRAPPC3LQ5T215 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRAPPC3LQ5T215 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
TRAPPC3LQ5T215 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRAPPC3LQ5T215 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRAPPC3LQ5T215 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRAPPC3LQ5T215 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRAPPC3LQ5T215 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
TRAPPC3LQ5T215 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRAPPC3LQ5T215 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRAPPC3LQ5T215 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRAPPC3LQ5T215 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRAPPC3LQ5T215 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRAPPC3LQ5T215 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRAPPC3LQ5T215 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRAPPC3LQ5T215 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRAPPC3LQ5T215 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRAPPC3LQ5T215 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRAPPC3LQ5T215 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRAPPC3LQ5T215 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRAPPC3LQ5T215 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRAPPC3LQ5T215 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
TRAPPC3LQ5T215 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRAPPC3LQ5T215 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRAPPC3LQ5T215 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC3LQ5T215 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC3LQ5T215 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC3LQ5T215 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC3LQ5T215 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC3LQ5T215 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC3LQ5T215 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC3LQ5T215 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC3LQ5T215 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC3LQ5T215 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC3LQ5T215 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC3LQ5T215 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC3LQ5T215 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC3LQ5T215 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms