Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPANXN3Q5MJ09 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms