Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMPD3Q5JV73 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMPD3Q5JV73 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMPD3Q5JV73 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMPD3Q5JV73 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMPD3Q5JV73 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMPD3Q5JV73 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMPD3Q5JV73 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMPD3Q5JV73 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMPD3Q5JV73 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMPD3Q5JV73 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMPD3Q5JV73 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMPD3Q5JV73 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMPD3Q5JV73 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMPD3Q5JV73 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMPD3Q5JV73 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMPD3Q5JV73 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMPD3Q5JV73 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMPD3Q5JV73 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMPD3Q5JV73 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMPD3Q5JV73 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMPD3Q5JV73 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMPD3Q5JV73 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMPD3Q5JV73 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMPD3Q5JV73 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMPD3Q5JV73 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMPD3Q5JV73 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMPD3Q5JV73 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMPD3Q5JV73 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMPD3Q5JV73 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMPD3Q5JV73 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD3Q5JV73 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD3Q5JV73 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD3Q5JV73 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD3Q5JV73 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD3Q5JV73 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRMPD3Q5JV73 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRMPD3Q5JV73 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRMPD3Q5JV73 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRMPD3Q5JV73 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMPD3Q5JV73 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMPD3Q5JV73 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMPD3Q5JV73 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMPD3Q5JV73 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMPD3Q5JV73 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMPD3Q5JV73 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FRMPD3Q5JV73 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms