Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8M3

EMC4, ER membrane protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC4Q5J8M3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMC4Q5J8M3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMC4Q5J8M3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMC4Q5J8M3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EMC4Q5J8M3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMC4Q5J8M3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMC4Q5J8M3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMC4Q5J8M3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMC4Q5J8M3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EMC4Q5J8M3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMC4Q5J8M3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMC4Q5J8M3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMC4Q5J8M3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMC4Q5J8M3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMC4Q5J8M3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMC4Q5J8M3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMC4Q5J8M3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMC4Q5J8M3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMC4Q5J8M3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMC4Q5J8M3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMC4Q5J8M3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMC4Q5J8M3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMC4Q5J8M3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMC4Q5J8M3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMC4Q5J8M3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMC4Q5J8M3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMC4Q5J8M3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMC4Q5J8M3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMC4Q5J8M3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMC4Q5J8M3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMC4Q5J8M3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms