Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
XKR3Q5GH77 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
XKR3Q5GH77 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XKR3Q5GH77 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
XKR3Q5GH77 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XKR3Q5GH77 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XKR3Q5GH77 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XKR3Q5GH77 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XKR3Q5GH77 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
XKR3Q5GH77 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
XKR3Q5GH77 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
XKR3Q5GH77 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
XKR3Q5GH77 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
XKR3Q5GH77 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
XKR3Q5GH77 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
XKR3Q5GH77 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XKR3Q5GH77 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
XKR3Q5GH77 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
XKR3Q5GH77 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XKR3Q5GH77 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
XKR3Q5GH77 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XKR3Q5GH77 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XKR3Q5GH77 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
XKR3Q5GH77 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
XKR3Q5GH77 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
XKR3Q5GH77 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
XKR3Q5GH77 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
XKR3Q5GH77 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XKR3Q5GH77 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms