Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CAVIN4Q5BKX8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CAVIN4Q5BKX8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CAVIN4Q5BKX8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CAVIN4Q5BKX8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CAVIN4Q5BKX8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CAVIN4Q5BKX8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CAVIN4Q5BKX8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CAVIN4Q5BKX8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAVIN4Q5BKX8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAVIN4Q5BKX8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAVIN4Q5BKX8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAVIN4Q5BKX8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAVIN4Q5BKX8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAVIN4Q5BKX8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAVIN4Q5BKX8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAVIN4Q5BKX8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAVIN4Q5BKX8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CAVIN4Q5BKX8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CAVIN4Q5BKX8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CAVIN4Q5BKX8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CAVIN4Q5BKX8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAVIN4Q5BKX8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAVIN4Q5BKX8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAVIN4Q5BKX8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAVIN4Q5BKX8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAVIN4Q5BKX8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAVIN4Q5BKX8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CAVIN4Q5BKX8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CAVIN4Q5BKX8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CAVIN4Q5BKX8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CAVIN4Q5BKX8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CAVIN4Q5BKX8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CAVIN4Q5BKX8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CAVIN4Q5BKX8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CAVIN4Q5BKX8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CAVIN4Q5BKX8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CAVIN4Q5BKX8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CAVIN4Q5BKX8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CAVIN4Q5BKX8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CAVIN4Q5BKX8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CAVIN4Q5BKX8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CAVIN4Q5BKX8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CAVIN4Q5BKX8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CAVIN4Q5BKX8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CAVIN4Q5BKX8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CAVIN4Q5BKX8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CAVIN4Q5BKX8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CAVIN4Q5BKX8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CAVIN4Q5BKX8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CAVIN4Q5BKX8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CAVIN4Q5BKX8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CAVIN4Q5BKX8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CAVIN4Q5BKX8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CAVIN4Q5BKX8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CAVIN4Q5BKX8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CAVIN4Q5BKX8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CAVIN4Q5BKX8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CAVIN4Q5BKX8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CAVIN4Q5BKX8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CAVIN4Q5BKX8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CAVIN4Q5BKX8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CAVIN4Q5BKX8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms