Protein–RNA interactions for Protein: Q5BIV9

SPRN, Shadow of prion protein, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRNQ5BIV9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPRNQ5BIV9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SPRNQ5BIV9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SPRNQ5BIV9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPRNQ5BIV9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPRNQ5BIV9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPRNQ5BIV9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRNQ5BIV9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRNQ5BIV9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRNQ5BIV9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRNQ5BIV9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRNQ5BIV9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRNQ5BIV9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRNQ5BIV9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRNQ5BIV9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRNQ5BIV9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRNQ5BIV9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRNQ5BIV9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRNQ5BIV9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRNQ5BIV9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRNQ5BIV9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRNQ5BIV9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPRNQ5BIV9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPRNQ5BIV9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPRNQ5BIV9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SPRNQ5BIV9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPRNQ5BIV9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPRNQ5BIV9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPRNQ5BIV9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPRNQ5BIV9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPRNQ5BIV9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPRNQ5BIV9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPRNQ5BIV9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPRNQ5BIV9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPRNQ5BIV9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPRNQ5BIV9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPRNQ5BIV9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPRNQ5BIV9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPRNQ5BIV9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPRNQ5BIV9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPRNQ5BIV9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPRNQ5BIV9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPRNQ5BIV9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPRNQ5BIV9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPRNQ5BIV9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPRNQ5BIV9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPRNQ5BIV9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPRNQ5BIV9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPRNQ5BIV9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPRNQ5BIV9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPRNQ5BIV9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPRNQ5BIV9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPRNQ5BIV9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms