Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRDTQ58F21 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRDTQ58F21 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRDTQ58F21 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRDTQ58F21 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRDTQ58F21 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRDTQ58F21 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRDTQ58F21 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRDTQ58F21 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRDTQ58F21 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRDTQ58F21 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRDTQ58F21 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
BRDTQ58F21 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
BRDTQ58F21 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRDTQ58F21 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRDTQ58F21 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRDTQ58F21 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRDTQ58F21 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRDTQ58F21 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRDTQ58F21 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRDTQ58F21 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRDTQ58F21 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRDTQ58F21 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRDTQ58F21 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRDTQ58F21 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRDTQ58F21 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRDTQ58F21 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRDTQ58F21 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRDTQ58F21 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms