Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LACTB2Q53H82 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LACTB2Q53H82 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LACTB2Q53H82 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LACTB2Q53H82 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LACTB2Q53H82 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LACTB2Q53H82 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LACTB2Q53H82 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LACTB2Q53H82 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LACTB2Q53H82 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LACTB2Q53H82 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LACTB2Q53H82 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LACTB2Q53H82 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LACTB2Q53H82 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LACTB2Q53H82 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LACTB2Q53H82 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LACTB2Q53H82 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LACTB2Q53H82 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LACTB2Q53H82 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LACTB2Q53H82 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LACTB2Q53H82 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LACTB2Q53H82 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LACTB2Q53H82 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LACTB2Q53H82 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LACTB2Q53H82 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LACTB2Q53H82 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LACTB2Q53H82 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LACTB2Q53H82 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LACTB2Q53H82 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LACTB2Q53H82 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LACTB2Q53H82 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LACTB2Q53H82 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LACTB2Q53H82 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LACTB2Q53H82 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LACTB2Q53H82 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LACTB2Q53H82 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LACTB2Q53H82 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LACTB2Q53H82 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LACTB2Q53H82 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LACTB2Q53H82 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LACTB2Q53H82 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LACTB2Q53H82 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LACTB2Q53H82 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LACTB2Q53H82 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LACTB2Q53H82 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LACTB2Q53H82 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LACTB2Q53H82 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LACTB2Q53H82 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LACTB2Q53H82 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LACTB2Q53H82 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LACTB2Q53H82 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LACTB2Q53H82 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms