Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMZ8

NKAIN1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKAIN1Q4KMZ8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKAIN1Q4KMZ8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKAIN1Q4KMZ8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKAIN1Q4KMZ8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKAIN1Q4KMZ8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKAIN1Q4KMZ8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKAIN1Q4KMZ8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKAIN1Q4KMZ8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKAIN1Q4KMZ8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKAIN1Q4KMZ8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKAIN1Q4KMZ8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKAIN1Q4KMZ8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKAIN1Q4KMZ8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKAIN1Q4KMZ8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKAIN1Q4KMZ8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKAIN1Q4KMZ8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKAIN1Q4KMZ8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKAIN1Q4KMZ8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKAIN1Q4KMZ8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKAIN1Q4KMZ8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKAIN1Q4KMZ8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKAIN1Q4KMZ8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKAIN1Q4KMZ8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKAIN1Q4KMZ8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKAIN1Q4KMZ8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NKAIN1Q4KMZ8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKAIN1Q4KMZ8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKAIN1Q4KMZ8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKAIN1Q4KMZ8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKAIN1Q4KMZ8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NKAIN1Q4KMZ8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NKAIN1Q4KMZ8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKAIN1Q4KMZ8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKAIN1Q4KMZ8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKAIN1Q4KMZ8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NKAIN1Q4KMZ8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKAIN1Q4KMZ8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NKAIN1Q4KMZ8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKAIN1Q4KMZ8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKAIN1Q4KMZ8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKAIN1Q4KMZ8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKAIN1Q4KMZ8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKAIN1Q4KMZ8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKAIN1Q4KMZ8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKAIN1Q4KMZ8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKAIN1Q4KMZ8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKAIN1Q4KMZ8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKAIN1Q4KMZ8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKAIN1Q4KMZ8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKAIN1Q4KMZ8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NKAIN1Q4KMZ8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKAIN1Q4KMZ8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKAIN1Q4KMZ8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKAIN1Q4KMZ8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKAIN1Q4KMZ8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms