Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CERKLQ49MI3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CERKLQ49MI3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CERKLQ49MI3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CERKLQ49MI3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CERKLQ49MI3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CERKLQ49MI3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CERKLQ49MI3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CERKLQ49MI3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CERKLQ49MI3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CERKLQ49MI3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CERKLQ49MI3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CERKLQ49MI3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CERKLQ49MI3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CERKLQ49MI3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CERKLQ49MI3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CERKLQ49MI3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CERKLQ49MI3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CERKLQ49MI3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CERKLQ49MI3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CERKLQ49MI3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CERKLQ49MI3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CERKLQ49MI3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CERKLQ49MI3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CERKLQ49MI3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CERKLQ49MI3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CERKLQ49MI3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CERKLQ49MI3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CERKLQ49MI3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CERKLQ49MI3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CERKLQ49MI3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CERKLQ49MI3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CERKLQ49MI3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CERKLQ49MI3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CERKLQ49MI3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CERKLQ49MI3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CERKLQ49MI3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CERKLQ49MI3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CERKLQ49MI3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CERKLQ49MI3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CERKLQ49MI3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CERKLQ49MI3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CERKLQ49MI3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CERKLQ49MI3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CERKLQ49MI3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CERKLQ49MI3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CERKLQ49MI3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CERKLQ49MI3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CERKLQ49MI3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CERKLQ49MI3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CERKLQ49MI3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CERKLQ49MI3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CERKLQ49MI3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CERKLQ49MI3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CERKLQ49MI3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CERKLQ49MI3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CERKLQ49MI3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CERKLQ49MI3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CERKLQ49MI3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CERKLQ49MI3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CERKLQ49MI3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CERKLQ49MI3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CERKLQ49MI3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CERKLQ49MI3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CERKLQ49MI3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms