Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHL38Q2WGJ6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL38Q2WGJ6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL38Q2WGJ6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL38Q2WGJ6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL38Q2WGJ6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL38Q2WGJ6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL38Q2WGJ6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL38Q2WGJ6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL38Q2WGJ6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL38Q2WGJ6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL38Q2WGJ6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL38Q2WGJ6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL38Q2WGJ6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL38Q2WGJ6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL38Q2WGJ6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL38Q2WGJ6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL38Q2WGJ6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL38Q2WGJ6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL38Q2WGJ6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL38Q2WGJ6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL38Q2WGJ6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL38Q2WGJ6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL38Q2WGJ6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL38Q2WGJ6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL38Q2WGJ6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL38Q2WGJ6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL38Q2WGJ6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL38Q2WGJ6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL38Q2WGJ6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL38Q2WGJ6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL38Q2WGJ6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL38Q2WGJ6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms