Protein–RNA interactions for Protein: Q2TB90

HKDC1, Putative hexokinase HKDC1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKDC1Q2TB90 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HKDC1Q2TB90 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HKDC1Q2TB90 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HKDC1Q2TB90 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HKDC1Q2TB90 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HKDC1Q2TB90 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HKDC1Q2TB90 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HKDC1Q2TB90 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HKDC1Q2TB90 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HKDC1Q2TB90 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HKDC1Q2TB90 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HKDC1Q2TB90 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HKDC1Q2TB90 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HKDC1Q2TB90 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HKDC1Q2TB90 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HKDC1Q2TB90 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HKDC1Q2TB90 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms