Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL67

PARP6, Poly [ADP-ribose] polymerase 6, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP6Q2NL67 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP6Q2NL67 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP6Q2NL67 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP6Q2NL67 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP6Q2NL67 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP6Q2NL67 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PARP6Q2NL67 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARP6Q2NL67 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PARP6Q2NL67 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PARP6Q2NL67 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PARP6Q2NL67 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PARP6Q2NL67 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PARP6Q2NL67 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PARP6Q2NL67 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP6Q2NL67 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP6Q2NL67 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP6Q2NL67 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP6Q2NL67 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP6Q2NL67 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP6Q2NL67 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP6Q2NL67 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP6Q2NL67 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms