Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF239Q16600 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF239Q16600 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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