Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CSRP2Q16527 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSRP2Q16527 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms