Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKN1Q16512 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PKN1Q16512 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKN1Q16512 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKN1Q16512 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKN1Q16512 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKN1Q16512 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKN1Q16512 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKN1Q16512 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKN1Q16512 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PKN1Q16512 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PKN1Q16512 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
PKN1Q16512 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PKN1Q16512 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKN1Q16512 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKN1Q16512 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKN1Q16512 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKN1Q16512 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKN1Q16512 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKN1Q16512 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKN1Q16512 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKN1Q16512 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKN1Q16512 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKN1Q16512 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PKN1Q16512 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PKN1Q16512 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PKN1Q16512 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PKN1Q16512 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PKN1Q16512 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PKN1Q16512 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKN1Q16512 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PKN1Q16512 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
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