Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA3Q16281 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNGA3Q16281 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
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