Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALX1Q15699 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALX1Q15699 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALX1Q15699 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALX1Q15699 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALX1Q15699 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALX1Q15699 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ALX1Q15699 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALX1Q15699 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALX1Q15699 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALX1Q15699 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALX1Q15699 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALX1Q15699 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALX1Q15699 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALX1Q15699 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALX1Q15699 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALX1Q15699 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALX1Q15699 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALX1Q15699 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALX1Q15699 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALX1Q15699 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALX1Q15699 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALX1Q15699 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALX1Q15699 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALX1Q15699 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALX1Q15699 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALX1Q15699 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ALX1Q15699 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ALX1Q15699 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ALX1Q15699 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ALX1Q15699 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ALX1Q15699 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALX1Q15699 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALX1Q15699 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ALX1Q15699 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALX1Q15699 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALX1Q15699 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALX1Q15699 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALX1Q15699 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALX1Q15699 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALX1Q15699 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALX1Q15699 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALX1Q15699 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALX1Q15699 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALX1Q15699 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ALX1Q15699 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ALX1Q15699 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ALX1Q15699 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ALX1Q15699 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ALX1Q15699 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ALX1Q15699 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ALX1Q15699 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ALX1Q15699 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALX1Q15699 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
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