Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 ATXN2L-210ENST00000562867 609 ntTSL 216.47■□□□□ 0.231e-8■■■■■ 52.5
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SF3B4Q15427 SKIV2L2-202ENST00000502953 557 ntTSL 44.64□□□□□ -1.673e-11■■■■■ 52.4
SF3B4Q15427 SKIV2L2-207ENST00000506750 3271 ntTSL 24.1□□□□□ -1.753e-11■■■■■ 52.4
SF3B4Q15427 SKIV2L2-206ENST00000505565 695 ntTSL 32.99□□□□□ -1.933e-11■■■■■ 52.4
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SF3B4Q15427 ILF3-207ENST00000587840 655 ntTSL 514.19□□□□□ -0.148e-14■■■■■ 52.4
SF3B4Q15427 ILF3-206ENST00000587505 791 ntTSL 513.92□□□□□ -0.188e-14■■■■■ 52.4
SF3B4Q15427 ILF3-214ENST00000589416 773 ntTSL 413.74□□□□□ -0.218e-14■■■■■ 52.4
SF3B4Q15427 ILF3-218ENST00000590009 953 ntTSL 512.26□□□□□ -0.458e-14■■■■■ 52.4
SF3B4Q15427 ILF3-211ENST00000589052 637 ntTSL 58.45□□□□□ -1.067e-16■■■■■ 52.4
SF3B4Q15427 NPC1-202ENST00000540608 2790 ntTSL 211.79□□□□□ -0.524e-9■■■■■ 52.4
SF3B4Q15427 MAT2A-201ENST00000306434 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.974e-7■■■■■ 52.4
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SF3B4Q15427 SHMT2-227ENST00000557269 576 ntTSL 511.43□□□□□ -0.585e-8■■■■■ 52.3
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SF3B4Q15427 SMPD4-204ENST00000430682 820 ntTSL 311.27□□□□□ -0.616e-11■■■■■ 52.3
SF3B4Q15427 KBTBD2-204ENST00000452926 537 ntTSL 412.02□□□□□ -0.497e-13■■■■■ 52.3
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SF3B4Q15427 KBTBD2-202ENST00000423022 556 ntTSL 35.39□□□□□ -1.557e-13■■■■■ 52.3
SF3B4Q15427 KBTBD2-205ENST00000453627 724 ntTSL 34.5□□□□□ -1.697e-13■■■■■ 52.3
SF3B4Q15427 ANO9-202ENST00000524802 671 ntTSL 1 (best)13.19□□□□□ -0.31e-11■■■■■ 52.3
SF3B4Q15427 PCNT-205ENST00000480896 10485 ntTSL 1 (best)10.27□□□□□ -0.772e-7■■■■■ 52.3
SF3B4Q15427 PCNT-201ENST00000359568 10560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.792e-7■■■■■ 52.3
SF3B4Q15427 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.013e-7■■■■■ 52.3
SF3B4Q15427 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.13e-7■■■■■ 52.3
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SF3B4Q15427 RABEPK-203ENST00000373544 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.755e-17■■■■■ 52.1
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SF3B4Q15427 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.214e-9■■■■■ 52.1
SF3B4Q15427 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.24e-9■■■■■ 52.1
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SF3B4Q15427 SAFB-204ENST00000586934 995 ntTSL 516.94■□□□□ 0.31e-12■■■■■ 52.1
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SF3B4Q15427 CLK1-215ENST00000621181 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.268e-9■■■■■ 52
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SF3B4Q15427 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.211e-14■■■■■ 52
SF3B4Q15427 TSC1-204ENST00000461879 492 ntTSL 35.59□□□□□ -1.511e-14■■■■■ 52
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SF3B4Q15427 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.229e-16■■■■■ 52
SF3B4Q15427 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.059e-16■■■■■ 52
SF3B4Q15427 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.129e-16■■■■■ 52
SF3B4Q15427 RPRD1A-208ENST00000589050 1022 ntTSL 1 (best)13.89□□□□□ -0.199e-16■■■■■ 52
SF3B4Q15427 RPRD1A-204ENST00000585953 2357 ntTSL 32.45□□□□□ -2.029e-16■■■■■ 52
SF3B4Q15427 RPRD1A-210ENST00000591994 2484 ntTSL 22.35□□□□□ -2.039e-16■■■■■ 52
SF3B4Q15427 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 03e-13■■■■■ 51.9
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SF3B4Q15427 SLC35C2-208ENST00000481809 872 ntTSL 514.23□□□□□ -0.133e-13■■■■■ 51.9
SF3B4Q15427 SLC35C2-205ENST00000420518 588 ntTSL 314.17□□□□□ -0.143e-13■■■■■ 51.9
SF3B4Q15427 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.163e-13■■■■■ 51.9
SF3B4Q15427 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.173e-13■■■■■ 51.9
SF3B4Q15427 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.193e-13■■■■■ 51.9
SF3B4Q15427 SLC35C2-210ENST00000484318 971 ntTSL 513.77□□□□□ -0.213e-13■■■■■ 51.9
SF3B4Q15427 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.263e-13■■■■■ 51.9
SF3B4Q15427 SLC35C2-206ENST00000424568 731 ntTSL 212.28□□□□□ -0.443e-13■■■■■ 51.9
SF3B4Q15427 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.744e-9■■■■■ 51.9
SF3B4Q15427 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.584e-9■■■■■ 51.9
SF3B4Q15427 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.564e-9■■■■■ 51.9
SF3B4Q15427 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.474e-9■■■■■ 51.9
SF3B4Q15427 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.384e-9■■■■■ 51.9
SF3B4Q15427 OTUB1-205ENST00000535140 638 ntTSL 316.86■□□□□ 0.294e-9■■■■■ 51.9
SF3B4Q15427 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.254e-9■■■■■ 51.9
SF3B4Q15427 OTUB1-201ENST00000301453 2493 ntTSL 215.58■□□□□ 0.084e-9■■■■■ 51.9
SF3B4Q15427 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.14e-9■■■■■ 51.9
SF3B4Q15427 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.31e-11■■■■■ 51.9
SF3B4Q15427 DCAF13-206ENST00000521999 779 ntTSL 512.17□□□□□ -0.461e-11■■■■■ 51.9
SF3B4Q15427 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.471e-11■■■■■ 51.9
SF3B4Q15427 DCAF13-208ENST00000612750 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.931e-11■■■■■ 51.9
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