Protein–RNA interactions for Protein: Q15424

SAFB, Scaffold attachment factor B1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAFBQ15424 ANGEL2-202ENST00000366962 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.461e-8■□□□□ 9.4
SAFBQ15424 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.091e-8■□□□□ 9.4
SAFBQ15424 FGL1-204ENST00000398056 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.374e-7■□□□□ 9.4
SAFBQ15424 RNF19A-211ENST00000523167 792 ntTSL 428.88■■■□□ 2.213e-7■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.83e-7■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.765e-9■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 TMEM37-204ENST00000465296 820 ntTSL 318.06■□□□□ 0.485e-9■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.475e-9■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 TMEM37-203ENST00000417645 522 ntTSL 316.94■□□□□ 0.35e-9■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 RNF19A-203ENST00000517584 317 ntTSL 1 (best)12.16□□□□□ -0.463e-7■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 RNF19A-210ENST00000522369 612 ntTSL 49.45□□□□□ -0.93e-7■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 RNF19A-213ENST00000523481 547 ntTSL 48.73□□□□□ -1.013e-7■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 RNF19A-202ENST00000432381 432 ntTSL 1 (best)8.22□□□□□ -1.093e-7■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.353e-7■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 RNF19A-206ENST00000519527 817 ntTSL 36.16□□□□□ -1.423e-7■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 ZNF146-202ENST00000456324 3780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.722e-7■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 CCDC26-202ENST00000520048 904 ntTSL 39.64□□□□□ -0.876e-6■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 CCDC26-203ENST00000523151 1496 ntTSL 1 (best)9.4□□□□□ -0.916e-6■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.266e-6■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.282e-7■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.832e-7■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 TPR-205ENST00000474852 2757 ntTSL 1 (best)18.64■□□□□ 0.572e-7■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.012e-7■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 FUS-213ENST00000570090 544 ntTSL 219.35■□□□□ 0.691e-13■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 AHSG-203ENST00000478441 1269 ntTSL 214.67□□□□□ -0.069e-10■□□□□ 9.2
SAFBQ15424 AHSG-201ENST00000273784 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.469e-10■□□□□ 9.2
SAFBQ15424 AHSG-202ENST00000411641 1711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.499e-10■□□□□ 9.2
SAFBQ15424 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.386e-6■□□□□ 9.2
SAFBQ15424 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.976e-6■□□□□ 9.2
SAFBQ15424 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.636e-6■□□□□ 9.2
SAFBQ15424 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.66e-6■□□□□ 9.2
SAFBQ15424 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.316e-6■□□□□ 9.2
SAFBQ15424 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.43e-7■□□□□ 9.2
SAFBQ15424 ZC3H11A-212ENST00000495527 8404 ntTSL 1 (best)6.04□□□□□ -1.443e-7■□□□□ 9.2
SAFBQ15424 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.583e-7■□□□□ 9.2
SAFBQ15424 ANKRD11-215ENST00000568512 294 ntTSL 210.47□□□□□ -0.737e-7■□□□□ 9.1
SAFBQ15424 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.114e-9■□□□□ 9.1
SAFBQ15424 FTX-211ENST00000603672 1077 ntTSL 513.67□□□□□ -0.224e-9■□□□□ 9.1
SAFBQ15424 FTX-209ENST00000602812 2356 ntTSL 1 (best)12.19□□□□□ -0.464e-9■□□□□ 9.1
SAFBQ15424 FTX-215ENST00000638681 9771 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.554e-9■□□□□ 9.1
SAFBQ15424 FTX-206ENST00000602420 751 ntTSL 36.38□□□□□ -1.394e-9■□□□□ 9.1
SAFBQ15424 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.464e-9■□□□□ 9.1
SAFBQ15424 FTX-218ENST00000641360 3897 nt5.85□□□□□ -1.474e-9■□□□□ 9.1
SAFBQ15424 RIF1-207ENST00000454583 3552 ntTSL 25.5□□□□□ -1.536e-7■□□□□ 9
SAFBQ15424 NKTR-211ENST00000468735 7964 ntTSL 28.84□□□□□ -0.991e-7■□□□□ 9
SAFBQ15424 NKTR-209ENST00000465584 3839 ntTSL 22.69□□□□□ -1.981e-7■□□□□ 9
SAFBQ15424 ROCK2-201ENST00000261535 1795 ntTSL 525.77■■□□□ 1.727e-7■□□□□ 9
SAFBQ15424 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.347e-7■□□□□ 9
SAFBQ15424 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.867e-7■□□□□ 9
SAFBQ15424 ZKSCAN1-202ENST00000426572 2011 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 07e-7■□□□□ 9
SAFBQ15424 ZKSCAN1-205ENST00000535170 8758 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.227e-7■□□□□ 9
SAFBQ15424 ZKSCAN1-206ENST00000620510 9192 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.337e-7■□□□□ 9
SAFBQ15424 ZKSCAN1-201ENST00000324306 9418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.67e-7■□□□□ 9
SAFBQ15424 ROCK2-206ENST00000462366 563 ntTSL 36.76□□□□□ -1.337e-7■□□□□ 9
SAFBQ15424 UBE2G2-205ENST00000478200 637 ntTSL 423.83■■□□□ 1.411e-8■□□□□ 9
SAFBQ15424 UBE2G2-212ENST00000497664 590 ntTSL 423.83■■□□□ 1.411e-8■□□□□ 9
SAFBQ15424 UBE2G2-209ENST00000491513 744 ntTSL 421.45■■□□□ 1.021e-8■□□□□ 9
SAFBQ15424 UBE2G2-211ENST00000497630 933 ntTSL 221.29■■□□□ 11e-8■□□□□ 9
SAFBQ15424 UBE2G2-204ENST00000477954 1034 ntTSL 317.69■□□□□ 0.421e-8■□□□□ 9
SAFBQ15424 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.371e-8■□□□□ 9
SAFBQ15424 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.241e-8■□□□□ 9
SAFBQ15424 UBE2G2-206ENST00000481546 4340 ntTSL 1 (best)9.83□□□□□ -0.841e-8■□□□□ 9
SAFBQ15424 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC6.16□□□□□ -1.427e-8■□□□□ 9
SAFBQ15424 AKAP9-204ENST00000394534 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)6.25□□□□□ -1.416e-7■□□□□ 9
SAFBQ15424 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.436e-7■□□□□ 9
SAFBQ15424 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.886e-7■□□□□ 9
SAFBQ15424 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.936e-7■□□□□ 9
SAFBQ15424 TTC28-201ENST00000397906 11795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.217e-7■□□□□ 8.9
SAFBQ15424 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.856e-7■□□□□ 8.9
SAFBQ15424 SMCHD1-206ENST00000581631 729 ntTSL 33.85□□□□□ -1.796e-7■□□□□ 8.9
SAFBQ15424 SMCHD1-203ENST00000577880 4951 ntTSL 23.57□□□□□ -1.846e-7■□□□□ 8.9
SAFBQ15424 SMCHD1-211ENST00000584897 4143 ntTSL 22.25□□□□□ -2.056e-7■□□□□ 8.9
SAFBQ15424 ABL1-202ENST00000372348 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.171e-6■□□□□ 8.9
SAFBQ15424 ABL1-203ENST00000393293 532 ntTSL 56.03□□□□□ -1.441e-6■□□□□ 8.9
SAFBQ15424 LUC7L3-209ENST00000506686 582 ntTSL 413.91□□□□□ -0.184e-7■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.197e-7■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.891e-8■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 SNTB1-203ENST00000519177 1962 ntTSL 1 (best)21.6■■□□□ 1.057e-7■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.997e-7■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 CTDSPL-204ENST00000435525 371 ntTSL 319■□□□□ 0.631e-8■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.287e-7■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.157e-7■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.137e-7■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 GK-211ENST00000487652 565 ntTSL 415.55■□□□□ 0.087e-7■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 GK-210ENST00000481024 2401 ntTSL 215.08■□□□□ 0.017e-7■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 GK-207ENST00000427190 4573 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.067e-7■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 GK-208ENST00000471362 420 ntTSL 313.45□□□□□ -0.267e-7■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 GK-209ENST00000479048 582 ntTSL 49.83□□□□□ -0.847e-7■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 CTDSPL-201ENST00000273179 4459 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.841e-8■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 PDXK-212ENST00000470029 583 ntTSL 322.06■■□□□ 1.121e-8■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 RNASET2-212ENST00000510083 2280 ntTSL 218.21■□□□□ 0.519e-7■□□□□ 8.7
SAFBQ15424 RNASET2-205ENST00000467705 524 ntTSL 511.6□□□□□ -0.559e-7■□□□□ 8.7
SAFBQ15424 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.079e-7■□□□□ 8.7
SAFBQ15424 RUNX1-216ENST00000482318 1710 ntTSL 1 (best)25.59■■□□□ 1.699e-7■□□□□ 8.7
SAFBQ15424 RUNX1-204ENST00000399237 822 ntTSL 523.95■■□□□ 1.429e-7■□□□□ 8.7
SAFBQ15424 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.989e-7■□□□□ 8.7
SAFBQ15424 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.739e-7■□□□□ 8.7
SAFBQ15424 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.739e-7■□□□□ 8.7
SAFBQ15424 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.559e-7■□□□□ 8.7
SAFBQ15424 FUS-211ENST00000568901 521 ntTSL 211.34□□□□□ -0.599e-7■□□□□ 8.7
Retrieved 100 of 1,659 protein–RNA pairs in 46.5 ms