Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SF3B3Q15393 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SF3B3Q15393 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SF3B3Q15393 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SF3B3Q15393 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SF3B3Q15393 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SF3B3Q15393 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SF3B3Q15393 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SF3B3Q15393 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SF3B3Q15393 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SF3B3Q15393 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SF3B3Q15393 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SF3B3Q15393 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SF3B3Q15393 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SF3B3Q15393 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SF3B3Q15393 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SF3B3Q15393 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
SF3B3Q15393 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SF3B3Q15393 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SF3B3Q15393 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SF3B3Q15393 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SF3B3Q15393 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SF3B3Q15393 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SF3B3Q15393 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SF3B3Q15393 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SF3B3Q15393 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SF3B3Q15393 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SF3B3Q15393 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SF3B3Q15393 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
SF3B3Q15393 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SF3B3Q15393 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SF3B3Q15393 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SF3B3Q15393 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SF3B3Q15393 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SF3B3Q15393 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SF3B3Q15393 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SF3B3Q15393 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SF3B3Q15393 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SF3B3Q15393 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SF3B3Q15393 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SF3B3Q15393 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SF3B3Q15393 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SF3B3Q15393 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SF3B3Q15393 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SF3B3Q15393 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SF3B3Q15393 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SF3B3Q15393 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
SF3B3Q15393 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SF3B3Q15393 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SF3B3Q15393 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SF3B3Q15393 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SF3B3Q15393 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SF3B3Q15393 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SF3B3Q15393 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SF3B3Q15393 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SF3B3Q15393 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SF3B3Q15393 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SF3B3Q15393 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SF3B3Q15393 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SF3B3Q15393 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SF3B3Q15393 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SF3B3Q15393 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SF3B3Q15393 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SF3B3Q15393 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SF3B3Q15393 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SF3B3Q15393 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SF3B3Q15393 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SF3B3Q15393 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SF3B3Q15393 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
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