Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCOLCEQ15113 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCOLCEQ15113 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 849.8 ms