Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCA4Q14CN2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCA4Q14CN2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLCA4Q14CN2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLCA4Q14CN2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms