Protein–RNA interactions for Protein: Q14746

COG2, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG2Q14746 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COG2Q14746 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COG2Q14746 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
COG2Q14746 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COG2Q14746 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COG2Q14746 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG2Q14746 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG2Q14746 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
COG2Q14746 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG2Q14746 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG2Q14746 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
COG2Q14746 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
COG2Q14746 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
COG2Q14746 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
COG2Q14746 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG2Q14746 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG2Q14746 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG2Q14746 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG2Q14746 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG2Q14746 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COG2Q14746 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
COG2Q14746 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COG2Q14746 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COG2Q14746 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COG2Q14746 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COG2Q14746 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COG2Q14746 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COG2Q14746 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COG2Q14746 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COG2Q14746 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COG2Q14746 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COG2Q14746 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COG2Q14746 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COG2Q14746 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COG2Q14746 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COG2Q14746 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG2Q14746 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG2Q14746 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG2Q14746 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG2Q14746 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG2Q14746 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
COG2Q14746 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG2Q14746 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG2Q14746 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG2Q14746 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COG2Q14746 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COG2Q14746 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COG2Q14746 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG2Q14746 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG2Q14746 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG2Q14746 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
COG2Q14746 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG2Q14746 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
COG2Q14746 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG2Q14746 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG2Q14746 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG2Q14746 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG2Q14746 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COG2Q14746 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COG2Q14746 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COG2Q14746 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COG2Q14746 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COG2Q14746 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COG2Q14746 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COG2Q14746 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG2Q14746 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG2Q14746 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG2Q14746 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG2Q14746 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG2Q14746 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG2Q14746 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG2Q14746 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG2Q14746 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG2Q14746 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG2Q14746 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG2Q14746 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG2Q14746 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG2Q14746 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG2Q14746 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
COG2Q14746 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG2Q14746 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG2Q14746 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COG2Q14746 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COG2Q14746 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COG2Q14746 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COG2Q14746 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COG2Q14746 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COG2Q14746 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COG2Q14746 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COG2Q14746 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
COG2Q14746 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COG2Q14746 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
COG2Q14746 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COG2Q14746 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
COG2Q14746 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG2Q14746 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG2Q14746 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG2Q14746 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG2Q14746 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG2Q14746 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms