Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB33AQ14088 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB33AQ14088 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB33AQ14088 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB33AQ14088 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB33AQ14088 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB33AQ14088 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB33AQ14088 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB33AQ14088 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB33AQ14088 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB33AQ14088 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB33AQ14088 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB33AQ14088 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB33AQ14088 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB33AQ14088 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB33AQ14088 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB33AQ14088 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB33AQ14088 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB33AQ14088 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB33AQ14088 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB33AQ14088 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB33AQ14088 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB33AQ14088 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB33AQ14088 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB33AQ14088 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB33AQ14088 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB33AQ14088 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB33AQ14088 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB33AQ14088 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB33AQ14088 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB33AQ14088 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB33AQ14088 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB33AQ14088 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB33AQ14088 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB33AQ14088 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB33AQ14088 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB33AQ14088 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB33AQ14088 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB33AQ14088 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB33AQ14088 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB33AQ14088 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB33AQ14088 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB33AQ14088 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB33AQ14088 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB33AQ14088 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB33AQ14088 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB33AQ14088 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB33AQ14088 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB33AQ14088 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB33AQ14088 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB33AQ14088 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB33AQ14088 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB33AQ14088 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB33AQ14088 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB33AQ14088 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB33AQ14088 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB33AQ14088 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
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