Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAPGEF1Q13905 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAPGEF1Q13905 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
RAPGEF1Q13905 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAPGEF1Q13905 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
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