Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX39BQ13838 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX39BQ13838 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX39BQ13838 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
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