Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUL4BQ13620 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUL4BQ13620 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUL4BQ13620 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUL4BQ13620 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUL4BQ13620 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUL4BQ13620 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUL4BQ13620 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUL4BQ13620 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUL4BQ13620 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CUL4BQ13620 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CUL4BQ13620 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CUL4BQ13620 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CUL4BQ13620 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CUL4BQ13620 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CUL4BQ13620 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CUL4BQ13620 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CUL4BQ13620 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CUL4BQ13620 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CUL4BQ13620 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CUL4BQ13620 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CUL4BQ13620 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CUL4BQ13620 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CUL4BQ13620 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CUL4BQ13620 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CUL4BQ13620 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CUL4BQ13620 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CUL4BQ13620 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CUL4BQ13620 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CUL4BQ13620 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CUL4BQ13620 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CUL4BQ13620 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CUL4BQ13620 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CUL4BQ13620 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CUL4BQ13620 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CUL4BQ13620 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CUL4BQ13620 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CUL4BQ13620 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CUL4BQ13620 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CUL4BQ13620 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CUL4BQ13620 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CUL4BQ13620 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CUL4BQ13620 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CUL4BQ13620 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CUL4BQ13620 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CUL4BQ13620 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CUL4BQ13620 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CUL4BQ13620 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CUL4BQ13620 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CUL4BQ13620 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CUL4BQ13620 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CUL4BQ13620 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CUL4BQ13620 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CUL4BQ13620 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CUL4BQ13620 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CUL4BQ13620 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CUL4BQ13620 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CUL4BQ13620 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CUL4BQ13620 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CUL4BQ13620 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CUL4BQ13620 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
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