Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTA1Q13424 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTA1Q13424 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTA1Q13424 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTA1Q13424 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTA1Q13424 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTA1Q13424 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTA1Q13424 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTA1Q13424 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTA1Q13424 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNTA1Q13424 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms