Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL49Q13405 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL49Q13405 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL49Q13405 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL49Q13405 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL49Q13405 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL49Q13405 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL49Q13405 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL49Q13405 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL49Q13405 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL49Q13405 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL49Q13405 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MRPL49Q13405 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MRPL49Q13405 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL49Q13405 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL49Q13405 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL49Q13405 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL49Q13405 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL49Q13405 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL49Q13405 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL49Q13405 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL49Q13405 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL49Q13405 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL49Q13405 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL49Q13405 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL49Q13405 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL49Q13405 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL49Q13405 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL49Q13405 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL49Q13405 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL49Q13405 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms