Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRJQ12913 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRJQ12913 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRJQ12913 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRJQ12913 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRJQ12913 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRJQ12913 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRJQ12913 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms