Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZNF543Q08ER8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZNF543Q08ER8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF543Q08ER8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF543Q08ER8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF543Q08ER8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF543Q08ER8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF543Q08ER8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF543Q08ER8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF543Q08ER8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF543Q08ER8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF543Q08ER8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF543Q08ER8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF543Q08ER8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF543Q08ER8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF543Q08ER8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF543Q08ER8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF543Q08ER8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF543Q08ER8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF543Q08ER8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF543Q08ER8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ZNF543Q08ER8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF543Q08ER8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF543Q08ER8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF543Q08ER8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF543Q08ER8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF543Q08ER8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF543Q08ER8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF543Q08ER8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF543Q08ER8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF543Q08ER8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms