Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DSC1Q08554 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DSC1Q08554 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DSC1Q08554 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DSC1Q08554 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DSC1Q08554 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DSC1Q08554 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DSC1Q08554 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DSC1Q08554 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DSC1Q08554 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DSC1Q08554 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DSC1Q08554 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DSC1Q08554 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DSC1Q08554 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DSC1Q08554 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DSC1Q08554 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DSC1Q08554 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DSC1Q08554 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
DSC1Q08554 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DSC1Q08554 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DSC1Q08554 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DSC1Q08554 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DSC1Q08554 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DSC1Q08554 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DSC1Q08554 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DSC1Q08554 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DSC1Q08554 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DSC1Q08554 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DSC1Q08554 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DSC1Q08554 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DSC1Q08554 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DSC1Q08554 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DSC1Q08554 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DSC1Q08554 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DSC1Q08554 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DSC1Q08554 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSC1Q08554 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSC1Q08554 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DSC1Q08554 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSC1Q08554 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DSC1Q08554 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DSC1Q08554 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DSC1Q08554 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DSC1Q08554 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DSC1Q08554 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DSC1Q08554 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DSC1Q08554 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DSC1Q08554 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DSC1Q08554 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DSC1Q08554 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DSC1Q08554 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DSC1Q08554 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms