Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
DDR1Q08345 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
DDR1Q08345 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
DDR1Q08345 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
DDR1Q08345 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
DDR1Q08345 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
DDR1Q08345 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
DDR1Q08345 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
DDR1Q08345 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
DDR1Q08345 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
DDR1Q08345 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
DDR1Q08345 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
DDR1Q08345 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
DDR1Q08345 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
DDR1Q08345 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
DDR1Q08345 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
DDR1Q08345 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
DDR1Q08345 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
DDR1Q08345 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
DDR1Q08345 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
DDR1Q08345 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
DDR1Q08345 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
DDR1Q08345 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
DDR1Q08345 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
DDR1Q08345 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
DDR1Q08345 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
DDR1Q08345 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
DDR1Q08345 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
DDR1Q08345 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
DDR1Q08345 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DDR1Q08345 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DDR1Q08345 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DDR1Q08345 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DDR1Q08345 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DDR1Q08345 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
DDR1Q08345 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
DDR1Q08345 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DDR1Q08345 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
DDR1Q08345 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DDR1Q08345 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
DDR1Q08345 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC30.6■■■□□ 2.49
DDR1Q08345 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DDR1Q08345 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
DDR1Q08345 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
DDR1Q08345 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
DDR1Q08345 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
DDR1Q08345 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DDR1Q08345 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DDR1Q08345 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DDR1Q08345 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
DDR1Q08345 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
DDR1Q08345 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms