Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF4Q08170 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF4Q08170 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms