Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CENPEQ02224 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPEQ02224 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPEQ02224 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPEQ02224 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms