Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPTBN1Q01082 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPTBN1Q01082 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTBN1Q01082 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTBN1Q01082 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms